Banca de DEFESA: LARISSA DA SILVA PEREIRA

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: LARISSA DA SILVA PEREIRA
DATA: 14/12/2020
HORA: 14:00
LOCAL: link: meet.google.com/yno-ffwa-qve
TÍTULO: Estudo teórico do mecanismo de ação da enzima RTA da Ricina com um ligante análogo ao substrato natural rRNA 28S
PALAVRAS-CHAVES: RTA, S´ıtio ativo, Dinˆamica molecular, Descritores de reatividade.
PÁGINAS: 120
GRANDE ÁREA: Ciências Exatas e da Terra
ÁREA: Química
SUBÁREA: Físico-Química
RESUMO: A Ricinus communis, planta conhecida no Brasil como mamona, tem ganhado atenção da indústria, da mídia e de governos, devido às propriedades de seus derivados, principalmente a ricina e o óleo ricinoléico. Este último, corresponde a 90% do óleo total que é extraído da semente da fruta e apresenta uma economia importante na indústria química. A ricina é uma toxina potente produzida no endosperma de sementes de mamona. É classificado como agente de ameaça biológica da categoria B de acordo com o Controle e Prevenção de Doenças (CDC) devido ao seu uso potencial como arma biológica. A ricina corresponde a uma proteína inativadora de ribossomo tipo 2 RIP e consiste em duas subunidades, RTA e RTB. Funcionalmente, o RTB internaliza o complexo RTA-RTB em células eucarióticas e o RTA catalisa a depurinação da adenina 4324 localizada na região Sarcin-Ricin Loop do 28S rRNA. Em vista dos riscos para a segurança representados pela ricina, o desenvolvimento de uma antitoxina é uma importante conquista farmacêutica e biotecnológica. No entanto, a grande dificuldade em projetar inibidores capazes de atuar de forma eficiente como bloqueadores RTA é atribuída ao entendimento incompleto do mecanismo de reação. Com o objetivo de obter maiores esclarecimentos sobre o mecanismo de ação do RTA, foi realizado um estudo teórico nesta dissertação utilizando a Dinâmica Molecular (DM) para monitorar a interação da subunidade catalítica do RTA com um substrato análogo natural. Cálculos de Química Quântica também foram realizados por meio de Descritores de Reatividade (DR) baseados na Teoria Funcional da Densidade Conceitual (CDFT). Em suma, a trajetória do DM revelou as principais ligações de hidrogênio presentes no RTA SA entre os resíduos Val81, Arg180 e Gly121 com a adenina alvo do ligante mímico. Além disso, demonstrou a ligação de hidrogênio ativando a adenina alvo em todas as simulações. As interações atrativas de estabilização de adenina pelos resíduos Tyr80, Tyr123, Val81, Gly121 e Glu208 e as interações repulsivas pelos resíduos Glu177 e Trp211, foram identificadas pelo estudo da energia de interação. O resíduo 327 também foi reconhecido como água catalítica no mecanismo, possivelmente ativado pelo Glu177. Finalmente, os descritores de reatividade revelaram a suscetibilidade ao ataque eletrofílico na adenina alvo através do resíduo Arg180, a estabilização da adenina em uma pilha pi entre os resíduos Tyr80 e Tyr123 e a propensão do Glu177 para doar densidade de elétrons e receber um próton da água catalítica.
MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - CARLOS HENRIQUE DA SILVEIRA
Presidente - 1520134 - GERD BRUNO DA ROCHA
Interno - 1348826 - WAGNER DE MENDONCA FAUSTINO