Banca de QUALIFICAÇÃO: LUIZ EDUARDO GOMES DA CRUZ

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: LUIZ EDUARDO GOMES DA CRUZ
DATA: 22/10/2025
HORA: 14:00
LOCAL: Auditório do Departamento de Geociências
TÍTULO: Interações Intermoleculares Não Covalentes: A Chave Para Desvendar Fenômenos Biológicos Envolvendo Proteínas
PALAVRAS-CHAVES: Interações Não Covalentes; NCIPLOT; Proteína-Ligante; Enzimas em Líquidos Iônicos; Enovelamento de Proteínas.
PÁGINAS: 122
RESUMO: O estudo aprofundado das interações não covalentes (INCs) revela-se crucial para a compreensão das forças fundamentais que governam a estrutura, a função e a dinâmica dos mais diversos processos biológicos envolvendo sistemas proteicos. O domínio e a racionalização dessas forças intermoleculares constituem o objetivo primário deste trabalho: desvendar informações-chave de fenômenos biológicos complexos através da análise detalhada das assinaturas de INCs. Para tanto, empregou-se uma abordagem robusta de modelagem computacional, centrada no método NCI utilizando a densidade promolecular, e complementada por extensas simulações de dinâmica molecular, cálculos avançados de clusterização e rigorosas análises estruturais. A metodologia desenvolvida foi aplicada a três problemáticas distintas e de alta relevância: a predição e racionalização do atracamento proteína-ligante, a investigação da estabilidade de enzimas na presença de líquidos iônicos, e a elucidação do mecanismo de enovelamento/desenovelamento proteico. Especificamente, demonstrou-se o desenvolvimento de um modelo preditivo da afinidade proteína-ligante baseado exclusivamente nas INCs, sendo implementado através do algoritmo de machine learning XGBoost, o que permitiu uma racionalização precisa das interações cruciais que ditam o reconhecimento molecular. Adicionalmente, realizou-se uma proposta de racionalização da termoestabilidade enzimática em ambiente de líquido iônico, estabelecendo uma conexão direta entre as características específicas das INCs e a resistência térmica da macromolécula. Por fim, foi desvendado um mecanismo para o processo de desenovelamento proteico, solidificando a perspectiva de que a manipulação e a compreensão das Interações não covalentes são centrais para o controle e a engenharia da dinâmica biológica. Todas as abordagens aplicadas constituem um conjunto de metodologias inovadoras aplicadas a problemas de alta relevância.
MEMBROS DA BANCA:
Presidente(a) - 1520134 - GERD BRUNO DA ROCHA
Interno(a) - 1673860 - MARCUS TULLIUS SCOTTI
Interno(a) - 2508141 - OTAVIO LUIS DE SANTANA
Interno(a) - 1348826 - WAGNER DE MENDONCA FAUSTINO