Banca de DEFESA: ÂNDELLO MYCHAEL FERREIRA SOARES DA SILVA

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: ÂNDELLO MYCHAEL FERREIRA SOARES DA SILVA
DATA: 30/10/2025
HORA: 14:00
LOCAL: Google Meet: https://meet.google.com/kyo-ximj-bfj
TÍTULO: Desenvolvimento de Função de Pontuação para Complexos Proteína-Ligante Baseados em Descritores Químico-Quânticos
PALAVRAS-CHAVES: Interações proteína–ligante; Função de pontuação; Descritores químico-quânticos; Métodos de Aprendizado de Máquina, Desenho racional de fármacos.
PÁGINAS: 113
GRANDE ÁREA: Ciências Exatas e da Terra
ÁREA: Química
SUBÁREA: Físico-Química
ESPECIALIDADE: Química Teórica
RESUMO: Esta dissertação apresenta o desenvolvimento de uma nova função de pontuação para complexos proteína–ligante baseada em descritores químico-quânticos e técnicas de aprendizado de máquina multivariadas. Um conjunto de dados do repositório PL-REX, composto por dez proteínas-alvo e 146 ligantes cristalográficos, foi utilizado como referência. Os cálculos semiempíricos foram realizados com o Hamiltoniano PM7 no software MOPAC, preservando as estruturas proteicas completas para considerar interações de longo alcance e potenciais efeitos alostéricos. Os descritores eletrônicos e de reatividade, derivados da Teoria do Funcional da Densidade Conceitual (CDFT), foram extraídos com o software PRIMoRDiA e analisados por meio da Análise de Componentes Principais (PCA). A PCA identificou de forma consistente a eletrofilicidade, a dureza, a moleza e os índices de Fukui como variáveis determinantes no comportamento dos ligantes. Como prova de conceito, Máquinas de Vetores de Suporte (SVM) foram aplicadas especificamente ao conjunto da protease do HIV-1, distinguindo com sucesso ligantes ativos e inativos. Em escala mais ampla, a regressão Kernel Regularized Least Squares (KRLS) foi empregada em todos os complexos, alcançando forte desempenho preditivo para energias livres de ligação (R2 ≈ 0,84). A análise dos efeitos marginais médios confirmou o papel complementar de descritores eletrônicos locais de reatividade (funções de Fukui, cargas atômicas, dureza, eletrofilicidade) na determinação da afinidade. Os resultados demonstram que descritores derivados de métodos quânticos fornecem informações preditivas e quimicamente interpretáveis sobre o reconhecimento molecular. A metodologia proposta constitui um arcabouço robusto e generalizável para o desenho racional de fármacos baseado em estrutura, com potencial aplicação em química medicinal e biotecnologia molecular.
MEMBROS DA BANCA:
Presidente(a) - 1520134 - GERD BRUNO DA ROCHA
Interno(a) - 1673860 - MARCUS TULLIUS SCOTTI
Interno(a) - 2508141 - OTAVIO LUIS DE SANTANA
Externo(a) ao Programa - 1743917 - THAIS GAUDENCIO DO REGO
Externo(a) à Instituição - KARINA DOS SANTOS MACHADO